La Corporación para el Conservatorio de Música de Puerto Rico será el organismo rector de Música 100x35: Sistema de Orquestas y Coros Juveniles e Infantiles de Puerto Rico. La Junta de Directores del Conservatorio regirá y supervisará las operaciones de Programa de Música 100x35: Sistema de Orquestas y Coros Juveniles e Infantiles de Puerto Rico y el Rector del Conservatorio, será el principal oficial ejecutivo.